Se non lo abbiamo fatto prima, alla fine del 40° capitolo, dopo aver sconfitto Dycerag e prima di tornare al monastero Orbonne per le battute finali, potremo portare a termine le missioni secondarie proposte dai baristi delle varie città, per ottenere guil o per diventare grandi cacciatori di tesori ed esploratori di terre sconosciute. Queste missioni possono essere svolte solo dai soldati comprati nelle officine, e si può scegliere di mandarne da 1 a 3 unità (meglio spedirne 3 per avere più chance di successo). Dopo un numero prestabilito di giorni dobbiamo tornare in
città e i nostri alleati faranno rapporto sulla spedizione.
Trovando rarità o luoghi, il barista ci nominerà TREASURE HUNTER (Cacciatore di tesori) o ADVENTURER (Avventuriero), potremo anche salire di livello man mano che aumenterà il numero di scoperte effettuate.

Ecco l'elenco dei 31 Tesori rari:
- Tobacco Pipe: Uno strumento utilizzato da ladri in Estremo Oriente. Normalmente viene usato per fumare, ma visto che è fatto di pietra Goldentight, può anche essere usato in battaglia.
- Kid's Break: Antica merenda per i bambini, simile al pane. Pochi sanno come farlo oggi ... solo un libro contiene la sua ricetta.
- Adult's Bread: Antica cibo per adulti contenente Stamina. Pochi sanno come farlo oggi ... solo un libro contiene la sua ricetta.
- Zeni-sword: Utilizzata per leggere il futuro ai commercianti itineranti. E' fatta con monete straniere a forma di spada.
- Black Cat: Un ornamentale gatto nero con occhi di lapislazzuli e unghie di diamanti. Molto antico e molto popolare fra i collezionisti.
- Malice Mask: Maschera di un demone gigante che ha stabilito quì il suo regno. Si dice che questi demoni siano la fonte di odio fra gli uomini.
- Four Gods Set: Questo set di miniature ricorda gli dei dell'Estremo Oriente. A giudicare dai suoi gioielli, deve essere appartenuto ad una nobile.
- Parade Helmet: Utilizzato nella parate dopo una vittoria, è molto pratico, ma mozza un pò il fiato. Un simbolo della gloria del mondo antico, è quasi completamente coperto di gioielli.
- Beetle Charm: Chiamato scarabeo in alcune aree, è un ornamento a forma di coleottero. Molto amato dal popolo, porta fortuna e fascino, luccica come un arcobaleno.
- Statue of Lylis: La statua di pietra della dea Lylis, si dice sia la fonte della vita o il primo diavolo. Si ritiene che il possessore di questa statua aumenti la sua forza. Uno degli oggetti preferiti dagli antichi guerrieri.
- Wyuvle: Se fosse stato pubblicato, si dice questo libro avrebbe cambiato la storia. E' il record della vita di una certa signora.
- Diary of Nanai: Lo psicologo Nanani ha analizzato molte persone in questo libro. Parte di esso racconta la vita di un giocatore.
- M-Fiction Novel: Prima edizione del ciclo di vita del salvatore Mesa. Purtroppo, la maggior parte del libro è danneggiato e solo una parte di esso può essere letta.
- Rat Tail: Sin dall'antichità, i maghi hanno usato questo oggetto come una magica medicina. Il desiderio per il suo sapore delizioso ha causato l'inizio di una guerra.
- White Materia: Nella antica città di Salonia, il popolo usava sigillare la loro saggezza dentro delle sfere magiche, per utilizzarle in futuro. Queste sfere sono chiamate Materia e aumentano le capacità di chi li possiede.
- Black Materia: Nella antica città di Salonia, il popolo usava sigillare la loro saggezza dentro delle sfere magiche, per utilizzarle in futuro. Queste sfere sono chiamate Materia e aumentano le capacità di chi li possiede.
- Blue Materia: Nella antica città di Salonia, il popolo usava sigillare la loro saggezza dentro delle sfere magiche, per utilizzarle in futuro. Queste sfere sono chiamate Materia e aumentano le capacità di chi li possiede.
- Red Materia: Nella antica città di Salonia, il popolo usava sigillare la loro saggezza dentro delle sfere magiche, per utilizzarle in futuro. Queste sfere sono chiamate Materia e aumentano le capacità di chi li possiede.
- Yurgeivogue: Popolare marionetta capaci di tenere l'attenzione dei bambini. Nessuno sa più come riprodurle, pertanto sono molto preziose.
- Calcobrina: Bambola in costume tradizionale, molto popolare tra le ragazze di questa zona, quando non c'era molto divertimento. La bambola contiene le memorie di quelle ragazze.
- Book of Enavia: Un record del Kusu Castle di Enavia. La parte più importante è scritto in una lingua antica che non può essere decifrata. Racconta la storia di 3 ragazze.
- Magical Gun: Un'antica pistola che si pensava fosse magica a causa dei suoi proiettili.
- St.Elmo's Fire: Questa fiamma blu si dice che proviega dal corpo umano. Quelli che la producono di solito sono affetti da qualche malattia. Si ritiene che un virus provochi questa infezione.
- Longibunne Spear: Leggendaria lancia usata per uccidere un demone che si era stabilito in queste terre. Si dice che sia in grado di perforare qualsiasi scudo.
- Chocobo Cannon: Con questo oggetto, si ottiene un grasso Chocobo in grado di sputare fuoco come un cannone. Raramente colpisce il bersaglio, non è mai stato utilizzato per scopi pratici. E 'stato fatto nel corso di un esperimento.
- Parasite Tree: Questo piccolo albero si nutre della corteccia dell'albero Yugudorucil. Una volta che attribuisce a sé l'albero, è di solito muore in mezza giornata. L'albero, che è difficile arrivare, si dice sia la medicina per eterna giovinezza.
- Excalibar: Una imitazione della leggendaria spada "Excalibur". Anche se è una copia, la sua somiglianza è straodinaria. 
- Tarot of Ben: Creato dal famoso artista Benstat. Esiste nel mondo un solo set, che è stato rubato dalla Lesalia Museum of Art qualche anni fa.
- M Machinegun: Un antico cannone montato su vari aeromobili del tempo. Il suo utilizzo varia a seconda del tipo di ricetta magica inserita. Molto utile.
- Magi-sword: Da un quasi indecifrabile iscrizione sulla spada, si è riuscito a leggere che con questa spada è stato ucciso un Warlock all'inferno con un sol colpo.
- Minu Orb: Questo è in realtà una sfera magica. Si chiama Minu Orb perché contiene l'anima del primo mago, Minu. E 'conosciuto anche come l'anima di Minu.

E questo è l'elenco dei 16 siti inesplorati:
- Matoya Cave: La grotta in cui visse il Mago Matoya, che servì l'antico regno di Ronkan. Egli era ben voluto dalla gente, ma dopo aver creato un demone, fu temuto come uno stregone.
- Magic Continent: Una volta si riteneva essere il cancello del paradiso o dell' inferno, ma di recente gli studiosi concordano che è il risultato di un grande impatto provocato dal crollo della pietra galleggiante all' interno della terra.
- Chocobo Forest: Pochissima luce entra in questa profonda foresta, dove vivono molti rari Chocobo selvatici. Al suo centro, si dice cresca "l'albero del mondo" Yugudoracil. C'è puzza di Chocobo...
- Floating Castle: Una volta degli uomini alati riuscirono a far galleggiare delle rocce. La stessa tecnologia fu utilizzata per questo castello. Ma con la scomparsa di questi uomini alati, questa tecnologia andò perduta.
- Shrine of Chaos: Tempo fa, le antiche divinità sigillarono Jade, il re degli inferi, in un profondo sotterraneo. Questo luogo è il Santuario del Caos, un santuario contaminato da un' aria di decadenza.
- Touzas Village: Un villaggio di nani chiamati Lillipuziani. Una volta era una dittatura. E' stato liberato da un gigante, Atlas. Touzas in origine significava "terra lontana".
- Tower of Babel: La leggendaria torre che raggiunge il cielo da un profondo sotterraneo. E' anche chiamata la Torre del gigante. Più che una leggenda, è una preziosa nota di un'antica civiltà.
- Forbidden Land Eureka: Secondo la leggenda, Eureka una volta era la prospera capitale del regno di Kashuka, che collassò a causa dell' enorme debito della famiglia reale. Oggi è una città fantasma, un ricordo del suo passato splendore.
- Mirage Tower: Questa torre è collegata a terra con l'antico castello di Ronkan. Una magia speciale riveste le pareti mantenendo la torre nascosta. A volte per un pò di tempo, può essere leggermente vista come un miraggio.
- Falgabird: Si dice sia stato il paese dove si nascondevano gli spadaccini magici. Perchè le spade magiche accorciavano la vita di chi le usava il numero di spadaccini diminuì assiduamente. Ora, tutto ciò che resta sono le case vuote
- Castle of Trials: in passato, questa è stata la scuola militare per il regno di Baron. Un eccezionale gruppo di piloti chiamato "Red Wing" fu graduato da questa Accademia. Anche un grande istituto di questo tipo è ormai distrutto.
- Semite Falls: Una delle più importanti aree dell' impero paramekiano. Il mythril può essere trovato all' interno di questa gigantesca cascata, e la sua acqua fu utilizzata come combustibile delle aeronavi dell' epoca. Davvero una cascata magica.
- Ronkan Ruins: Dall'alto, l'impero Ronkan ha guardato il mondo. Ma a causa di una misteriosa malattia, l'intera civiltà è stata distrutta. Oggi, solo un castello vuoto rimane tranquillamente galleggiante.
- Cristal Tower: Il castello dell'antico regno di Baron. La città è stata costruita come un labirinto per tenere fuori gli estranei. Il castello è fatto di puro cristallo per rappresentare il potere e la ricchezza della famiglia reale. Fu costruito interamente a spese del popolo.
- Pandemonium: La precedente capitale dell' antico impero di Paramekia. Circondata da una catena montuosa lunga 9000 m, neanche le aeronavi potevano accedervi. L'unico modo per raggiungere la città era attraversare un corridoio che passa per l'inferno.
- Magic Train: Un treno per trasporti. Utilizzato durante la guerra per il trasporto di demoni di origine umana, è ora conosciuto come Treno Magico. E' anche talvolta chiamato il 'corriere dei morti'.

Nota: Da notare che MATOYA CAVE, SHRINE OF CHAOS e MIRAGE TOWER sono luoghi presenti anche in FF1, quindi sono citazioni di vecchi FF! Inoltre l'Impero di Paramekia è presente anche in FF2!

Da notare le 4 Materie (bianca, nera, blu e rossa) appartenute all'antico popolo di maghi di Solonia, chiaro riferimento al precedente FF7 e il Rat Tail (Coda di topo) che ritroveremo in FF9, sempre come rarità.