LA REGINA BRAHNE
Brahne è la regina di Alexandria, nonchè matrigna di Garnet, non si sa come improvvisamente il suo comportamento muta: diventa crudele e malvagia nei confronti di tutti, ed aspira a diventare sempre più potente. La sua brama di conquista è forte a tal punto da voler addirittura sacrificare Garnet, per estrarre dal suo corpo gli Spiriti d'Invocazione, tramite un rituale che potrebbe portare la ragazza alla morte. Si allea addirittura con il perfido Kuja, un fabbricante di armi mortali, che nutre gli stessi piani di conquista della donna, che alla fine gli si rivolterà contro, scagliandole contro le sue stesse armi.
BEATRIX
Beatrix è il comandande delle Guardie del Castello di Alexandria, antagonista dei Cavalieri di Plutò, è infatti in lotta con Steiner per diventare la protettrice reale preferita. In realtà non c'è gara, in quanto le truppe di Beatrix sono ben disciplinate e preparate, a differenza dei Cavalieri di Steiner. Tutte le volte che ci scontreremo con lei le prenderemo sempre di santa ragione, ma non appena la Shogun si renderà conto del tremendo piano di Brahne, diventerà una nostra fedele alleata.
I TANTALUS
Questa banda di ladri, di cui fa parte Gidan, è stata assoldata dal Reggente Cid per rapire la principessa Garnet. Il gruppo viaggia per il mondo di Gaia in cerca di lavoro, facendo di tutto in cambio di denaro; sono come una grande famiglia, avendo vissuto insieme a lungo, si fidano l'uno dell'altro. Kalò è il leader, un uomo grosso con la barba, che nessuno può sfidare senza soccombere, Blank, Marcus, Er Cina e i Fratelli Puddu compongono il resto della ciurma.
ZON E SON
Questi due gemelli giullari sono al servizio della regina Brahne, cercheranno in tutti i modi di ostacolarci lungo il nostro cammino: sono loro infatti i creatori dei Black Waltz che ci ritroveremo ad affrontare durante il gioco; inoltre riusciranno a compiere il rito di estrazione degli Spiriti d'Invocazione dal corpo di Garnet, mettendo a rischio la sua vita.
REGGENTE CID
Cid è il governatore di Lindblum, è lui che ingaggia i Tantarus affinchè rapiscano Garnet, allo scopo di salvaguardare la sua incolumità. Purtroppo si troverà in un bel impiccio: dopo essere stato scoperto dalla moglie nel bel mezzo di una tresca amorosa con una cameriera, è stato trasformato in uno scaraburi dalla consorte, che poi è fuggita a bordo dell'ultima invenzione del reggente, un'idrovolante. Cid vorrebbe costruirne altre, ma il suo cervello non è più lo stesso ora che è diventato uno scaraburi. Riuscirà mai a tornare al suo stato originario?

IL PRINCIPE PUCK
Puck è figlio del re di Burmesia, incontrerà Vivi all'inizio del gioco ad Alexandria, durante la rappresentazione teatrale. Non si scopre subito la sua vera identità, in quanto Vivi crede che sia un topo qualunque e decide di seguirlo nella sua avventura al castello. Ha dovuto imparare a sopravvivere nel corso dei suoi viaggi, alla ricerca anche lui di Sir Flatrey ed aiuterà in tutti i modi il gruppo, non appena ne avrà l'occasione.
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