La nostra amica Yuffie Inanzitutto salva il gioco e con il PHS metti Yuffie nella squadra, equipaggiala con la Materia migliore e dirigiti alla Pagoda of the Five Mighty Gods a Wutai. Goorikii, l'uomo che sta lì seduto, ci dice che Yuffie avrebbe potuto dimostrare la sua abilità nel combattimento, affrontando i cinque guardiani della Pagoda delle Cinque Forze. Accettiamo e Yuffie dovrà affrontare un avversario dopo l'altro verso la cima della Pagoda. Dopo ogni battaglia ripristina Hp ed Mp, puoi anche salvare e cambiare la Materia equipaggiata. L'ordine dei combattimenti è questo:

PRIMO PIANO - GORKY
LV: 30 - HP: 3000 - MP: 150

Equipaggia l'armatura di Yuffie con Elemental-Gravity Materia oltre che Cure, Barrier e Counter Attack. Gorky usa spesso Demi 2 e Barrier, ma Yuffie non farà fatica ad attaccare; dopo aver usato Haste, attacca ripetutamente con il Deathblow Materia, interrompendo solamente per curarti. Non era uno scontro difficile per lei e otterrai una X-Potion.

SECONDO PIANO - SHAKE
LV: 32 - HP: 4000 - MP: 180

Shake è una specie di pinguino, e la stessa strategia usata con Gorky andrà benone; utilizza anche la Barrier in particolare per ridurre il suo Furious Bomber Attack che è abbastanza violento, ma accresce rapidamente il tuo Limit. Usa anche Choco-Mog per paralizzarlo, alla fine riceverai un Turbo Ether.

TERZO PIANO - CHEKHOV
LV: 34 - HP: 5000 - MP: 210

Equipaggia Yuffie con un Jem Ring, così da proteggerla dallo Stare Down di Chekhov, utilizza come prima cosa Haste e Barrier, negli attacchi usa il Deathblow. Un Ice Ring è il premio per la vittoria.

QUARTO PIANO - STANIV
LV: 36 - HP: 6000 - MP: 240

In questo combattimento Staniv continuerà a bersagliarti con il suo attacco principale, ovvero War Cry, che causa Sadness. Usa Barrier ed Hastee continua a ripristinare gli Hp, riceverai un Elixir.

QUINTO PIANO - GODO
LV: 41 - HP: 10000 - MP: 1000

Godo è il padre di Yuffie, per affrontarla invocherà un mostro a tre teste; il suo stile di combattimento muta a seconda della testa che mostra. Ha parecchi attacchi tra cui la Trine Enemy Skill (che potrete imparare) e l'abilità di succhiare i suoi HP. Ha anche una buona dotazione di MP che gli consente di curarsi molto spesso per 1200 punti per volta; equipaggia Yuffie con Counter Attack, Heal, Cure, Time e Barrier Materia. Poi inserisci nella sua arma la combinazione Added Effect- Poison. Lancia subito qualche Ghost Hand Item se ne possiedi e usa il Magic Hammer Enemy Skill (che avevamo imparato dai Razor Weeds, delle creature simile a fasci d'erba che vivevano a nord del paese) per diminuire i suoi MP velocemente. Usa anche Haste e Barrier e Regen. Alla fine per tutte le sue fatiche Godo la ripagherà con il Manuale per il suo Limit di livello 4, All Creation.

Ma suo padre aveva in serbo un'altra grande sorpresa per tutti noi: il Leviathan Materia, una Summon che ci permette di affrontare al meglio gli avversari vulnerabili all'acqua.