Non tutte le Materia sono reperibili durante il normale evolversi del gioco, per alcune è necessario compiere particolari azioni o andare in certi luoghi del mondo. Ecco l'elenco delle Materia rare di Final Fantasy 7:

- Knights of The Round Materia: occorre avere un Chocobo d'Oro, raggiungete la zona Nord-Est della mappa, lì troverete una piccola isola nascosta con una caverna. Entrateci e parlate alla luce rossa per ricevere la magia più potente del gioco.

- Typoon Materia: dopo aver sconfitto Ultimate Weapon andate all'Ancient Forest, esplorate bene la parte con una serie di liane tra gli alberi e troverete la Typoon.

- Bahamut Zero Materia: la otterrete parlando alla Blue Huge Materia a Cosmo Canyon solo se avrete anche la Bahamut e la Neo Bahamut Materia.

- Leviathan Materia: la otterrete da Godo dopo aver completato la sfida di Yuffie (vedi sezione Segreti).

- Alexander Materia: sconfiggi Snow al Great Glacier.

- Mime Materia: la troverete nel continente più a Ovest della mappa (Wutai), in una caverna ad Est di tale regione. Sarebbe meglio avere un chocobo d'oro per raggiungerla, parlate alla luce gialla per ottenere la Mime Materia.

- W-item Materia: nel terzo disco, dopo essere rientrati a Midgar, una volta arrivati nelle rotaie sotterranee, andate a sud sinchè non troverete un Save Point. Ispezionate bene la zona e troverete la W-item.

- HP<->MP Materia: dovrete dirigervi verso la montagna che sorge vicino al Gold Saucer, oltre il sentiero sulla parte bassa del fiume. Avrete bisogno di un chocobo blu, nero o dorato per raggiungere questa caverna, parla alla luce viola e otterrai la Materia.

- Steel as Well Materia: si trova in una grotta nella Da-Chao Cave a Wutai, ma essendo in una grotta infuocata non potrai recuperarla senza le Leviathan Scales, che si trovano in una cassa nel molo dove attraccano i sommergibili della Shinra (prima della battaglia sottomarina).

- Quadra Magic Materia: è nella caverna alla fina della penisola Nord dell'isola di Mideel. Sarebbe meglio andarci in groppa ad un chocobo dorato ma va bene anche blu se atterrate nella zona erbosa della piccola isola vicina, correndo lungo l'acqua bassa. Entrate nella caverna, parlate alla luce azzurra e avrete la Quadra Magic.

- Contain Materia: si trova a Mideel (prima che venga distrutta), quando esplorerete i vari negozi troverete un negoziante in preda al panico, costantemente pedinato da un piccolo chocobo bianco. Nutri il chocobo con un Mimmett Green e poi solleticale dietro le orecchie. Tossirà espellendo la Contain Materia.